Ohjausjärjestelmä on yksi tärkeimmistä järjestelmistä turvallisen veneilyn kannalta.
Veneet on varustettu hydraulisella ohjaustehostimella tai sähköisellä ohjaustehostimella. Lisätietoja on perämoottorin ja ohjausjärjestelmän valmistajan toisiinsa liittyvissä käsikirjoissa, jotka sisältyvät veneen mukana toimitettuun käsikirjapakettiin.
Ohjaustehostinjärjestelmässä on ohjauspumppu, joka helpottaa veneen käsittelyä.
Sähköiseen ohjausjärjestelmään sisältyvät sähköinen toimilaite, kaapelit ja sähköinen ohjaus.